Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms