Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall2Q9QX96 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms