Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms