Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms