Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Txnrd1Q9JMH6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms