Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sfmbt1Q9JMD1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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