Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rabgef1Q9JM13 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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