Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfrsf19Q9JLL3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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