Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Prg3Q9JL95 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg3Q9JL95 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg3Q9JL95 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prg3Q9JL95 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg3Q9JL95 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg3Q9JL95 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prg3Q9JL95 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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