Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms