Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms