Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfra4Q9JJT2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms