Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms