Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms