Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms