Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clstn1Q9EPL2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms