Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnft1Q9DCN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms