Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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