Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Riok3Q9DBU3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms