Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Tmem239Q9DA47 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Tmem239Q9DA47 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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