Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms