Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx5Q9D8U8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Snx5Q9D8U8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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