Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl17Q9D8P4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms