Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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