Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ptp4a3Q9D658 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptp4a3Q9D658 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms