Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc130Q9D516 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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