Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms