Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl28Q9D1B9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms