Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms