Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Susd3Q9D176 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms