Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms