Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc47Q9D024 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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