Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mis12Q9CY25 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mis12Q9CY25 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms