Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpusd4Q9CWX4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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