Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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