Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms