Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccer1Q9CQL2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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