Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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