Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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