Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cep41Q99NF3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms