Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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