Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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