Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms