Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms