Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms