Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed9Q99KF1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms