Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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CsprsQ99388 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CsprsQ99388 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CsprsQ99388 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CsprsQ99388 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms