Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms