Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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