Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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