Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atl3Q91YH5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atl3Q91YH5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atl3Q91YH5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl3Q91YH5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atl3Q91YH5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atl3Q91YH5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atl3Q91YH5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms